我们的未来基于平衡，在远离地球的宇宙飞船SCORPIO ONE上。这时没有重量，只有超先进的电脑技术贺优秀的科学家。然而，正是他们，全部都死于一次神秘的氧气事情中。刚从伊拉克沙漠抢险回来的CIA特别人马JARED STONE驾驶宇宙穿梭机进入…

太空探测器发出的怪声导致地球风暴，并面临自毁的威胁。寇克船长和他们的船员再度担负起拯救人类的使命。他们发现怪声其实是座头鲸的呼唤，唯一的选择就是回到20世纪去带回一只座头鲸来对探测器作出回应。