故事的舞台设定在虚构的日本都市，建立在开拓之地、城市人口锐减的洲笼市。住在那里的高中生阿形胜平，不知为何拥有了感知不到疼痛的身体。在暑假将至的某天，胜平通过谜之少女园崎法子的指点，获悉自己已被选为了疼痛共享的系统“羁绊者…

“我与你一同飞向天空。”甘粕桧曾根，是最近开始在航空自卫队岐阜基地任职的新人。过于率直而总是无意识地伤害他人，对此感到疲惫不堪的她，选择成为任期限定的自卫官。但，命运的邂逅彻底改变了她的人生。被秘藏在基地中、伪装成战斗机…