太空探测器发出的怪声导致地球风暴，并面临自毁的威胁。寇克船长和他们的船员再度担负起拯救人类的使命。他们发现怪声其实是座头鲸的呼唤，唯一的选择就是回到20世纪去带回一只座头鲸来对探测器作出回应。

2005年7月26日这天对大多数人来说是个噩耗，就是在这一片混乱和悲剧之中，有两个人成为恋人。随后的六年，两人分居不同的世界。值得庆幸的是，这一切已经成为过去。他们乘坐同一航班返回孟买，整个航程犹如坐过山车般。他们看到了这个城…